A bandeira reúne dois elementos: a floresta, no triângulo junto ao mastro, e as três águas da bacia amazônica, nas faixas que correm até a tralha. O sol de oito raios marca o campo da floresta.
As águas aparecem na ordem em que se distribuem no território, do norte para o sul, da direita para a esquerda: a água preta, à direita, do Rio Negro e seus afluentes; a água barrenta, no meio, do Solimões-Amazonas, tronco do sistema; e a água clara, à esquerda, do Tapajós, do Xingu e do Tocantins. Os filetes brancos entre elas lembram o Encontro das Águas, onde os rios correm lado a lado sem se misturar.
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